Le CROISADE est organisé ainsi qu'il suit :

• Un Congrès qui se tient chaque 2 ans ;
• Une Assemblée Générale qui se tient tous les ans ;
• Un Comité de Coordination Nationale ;
• Un Commissariat aux comptes ;
• Trois commissions spécialisées chargées d'assister le Comité de Coordination Nationale dans les domaines suivants :
• Les droits civils et politiques
• Les droits économiques, sociaux et culturels
• Le développement humain durable
• Huit (8) Comités de Coordination régionale
• Trente six comités de coordination départementale
• Des comités de coordination locale.